香蕉AP2/ERFs超家族的重新鉴定及在果实采后成熟过程中的差异表达特性
张海波1
郑云柯2
付毛妮3
张建斌2
贾彩红3
李新国4
刘菊华2
1.海南大学热带农林学院·热带作物生物育种全国重点实验室,海口 570228;中国热带农业科学院三亚研究院,海南三亚 5720002.中国热带农业科学院三亚研究院,海南三亚 572000;中国热带农业科学院热带生物技术研究所·农业农村部热带生物技术重点实验室,海口 5711013.中国热带农业科学院热带生物技术研究所·农业农村部热带生物技术重点实验室,海口 5711014.海南大学热带农林学院·热带作物生物育种全国重点实验室,海口 570228
摘要：[目的]在全基因组水平上重新鉴定香蕉A基因组中的AP2/ERF家族成员,研究其在香蕉果实采后成熟过程中的差异表达特性,明确可能参与香蕉果实成熟调控的关键基因.[方法]对香蕉A基因组中AP2/ERF家族成员进行系统进化、结构特征、蛋白质特性、保守结构域分析和两大类主栽品种巴西蕉(AAA)和粉蕉(ABB)果实采后成熟不同阶段的转录组分析.[结果]发现AP2/ERFs家族共有317个家族成员,分为AP2(49个)、ERF(253)和RAV(15)三个亚家族,他们不均匀地分布在染色体上.根据保守结构域和基因结构特征,ERF又分为a、b、c、d、e、f、h、i、j和k共10个亚类.转录组分析结果表明,在巴西蕉果实采后成熟过程中差异表达的AP2/ERFs家族成员有77个,其中高水平表达的有MaERF15、36、42和AP2-28.在粉蕉果实采后成熟过程中差异表达的AP2/ERFs家族成员有74个,其中高水平表达的有MaERF42和AP2-28.同时在巴西蕉和粉蕉果实成熟过程中差异表达的基因有57个,其中高水平表达的基因有MaERF15、42和AP2-28,只在巴西蕉果实中特异表达的有20个,只在粉蕉中特异表达的有17个.[结论]重新鉴定了香蕉AP2/ERFs超家族成员及其在果实后熟过程中的差异表达特性,为系统深入解析香蕉AP2/ERF基因功能奠定了基础,对为调控香蕉果实成熟提供靶标基因具有一定的理论意义.
关键词：香蕉AP2/ERFs全基因组分析果实成熟差异表达分析
分类号：S668.1(果树园艺)
资助基金：国家自然科学基金(32172269)国家香蕉产业技术体系项目(CARS-31)热带作物生物育种全国重点实验室科研项目(NKLTCB202301)
论文发表日期：2024-05-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：14( 861-874 )
英文信息