猕猴桃溃疡病病原菌MLVA分型引物的筛选及验证
姚令1
王海2
黄露1
安星宇1
陈文1
王莉爽1
薛原3
吴石平1
1.贵州省农业科学院植物保护研究所·农业农村部喀斯特山区作物基因资源与种质创新重点实验室,贵阳 5500062.贵州省农业科学院农业科技信息研究所,贵阳 5500063.贵州省烟草公司安顺市公司,贵州安顺 561000
摘要：[目的]筛选出一组可精准快速地对丁香假单胞菌猕猴桃致病变种(Pseudomonas syringae pv.actinidiae,Psa)进行分型的引物组合.[方法]针对前期文献己报道的34对引物,采用PCR技术验证该34对引物对中国Psa菌株的扩增效率及准确性;利用模拟PCR获取菌株串联重复(TR)数;以辛普森指数(Simpson's index,SI)作为筛选引物组合的标准,基于R软件平台,筛选最优引物组合.[结果]34对引物对中国Psa扩增效果均良好,其中TR14与TR11II、TR19与Psa-01引物序列相同;TR8 与 Psa-08、TR39II与Psa-10、GM-1834与TR10I、GM-1553 与 TR64II、TR19Psa-01与TR19II扩增同一 TR;Psa-09扩增产物串联重复单元长度不唯一,TR2II扩增产物侧翼变异较大,不能通过电泳确定串联重复数;最终确定SI值与全部引物组合相同的最低引物数量为9对,使用该9对引物的组合可将Psa己知的5种生物型准确分开.[结论]TR23/Psa-04、Psa-03、Psa-05、Psa-06、TR10IGM-1834、TR30I、TR1II、Psa-10TR39II、TR64IIGM-1553等9对引物可代表当前文献报道的34对引物,进行Psa分型研究,探索猕猴桃溃疡病的传播和流行规律,为病害防控策略的制定提供科学依据.
关键词：丁香假单胞菌猕猴桃致病变种多位点串联重复序列分析群体遗传结构引物筛选
分类号：S663.4(果树园艺)S436.634(病虫害及其防治)
论文发表日期：2024-06-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 1188-1198 )
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