枇杷HD-Zip Ⅰ转录因子家族全基因组鉴定及表达模式分析
赵双1
朱静雯2
陈甜甜2
王鹏凯2
郄红丽3
王化坤3
尤伟忠3
1.苏州农业职业技术学院,江苏苏州 215008;江苏省太湖常绿果树技术推广中心,江苏苏州 2151072.苏州农业职业技术学院,江苏苏州 2150083.江苏省太湖常绿果树技术推广中心,江苏苏州 215107
摘要：[目的]同源结构域-亮氨酸拉链(HD-Zip)转录因子参与多种植物的非生物胁迫响应过程.然而,在枇杷中,HD-Zip Ⅰ基因家族尚未被鉴定.[方法]利用生物信息学方法对全基因组范围内枇杷HD-Zip Ⅰ基因家族成员进行鉴定和综合分析,通过qRT-PCR法分析基因家族成员在枇杷不同组织和干旱胁迫下的表达特征.[结果]在枇杷基因组中筛选出20个HD-Zip Ⅰ家族成员.共线性分析结果发现了3对串联复制序列和22对片段复制序列,表明串联复制和片段复制可能促进了枇杷HD-Zip Ⅰ基因家族的扩张.蛋白序列比对分析表明,所有的HD-Zip Ⅰ家族成员均具有高度保守的HD和Zip结构域.系统发育分析表明,枇杷HD-Zip Ⅰ家族可以分为7个分支.HD-Zip Ⅰ各基因在枇杷不同组织中的表达模式有所差异.启动子序列分析表明,HD-Zip Ⅰ家族成员的启动子上含有多个与干旱胁迫和胁迫相关激素信号响应的顺式作用元件.干旱处理能够诱导EjHB9、EjHB10、EjHB17、EjHB18和EjHB20在叶片中的表达显著上调,预示着这些基因参与枇杷对干旱胁迫的响应.[结论]鉴定出5个受干旱胁迫显著诱导表达的枇杷HD-Zip Ⅰ基因,为进一步研究HTD-Zip Ⅰ基因在响应枇杷干旱胁迫中的分子功能提供理论依据.
关键词：枇杷HD-Zip Ⅰ转录因子全基因组鉴定表达分析
分类号：S667.3(果树园艺)
资助基金：苏州市科技发展计划(农业关键核心技术攻关)指导性项目(SNGD202303)江苏省林业科技创新与推广项目(LYKJ(2020)28)江苏省种业振兴揭榜挂帅项目(JBGS(2021)019)江苏省高校青蓝工程项目(2024)
论文发表日期：2024-10-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：13( 2025-2037 )
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