三个多倍体猕猴桃基因组Survey分析及系统进化研究
周嘉1
王飞飞2
仲伟敏1
齐勇1
刘青1
史斌斌1
张晟1
牛歆雨3
郑乾明1
唐冬梅1
1.贵州省农业科学院果树科学研究所,贵阳5500062.贵州省农业科学院果树科学研究所,贵阳550006;西藏农牧学院植物科学学院,西藏林芝 8600003.西藏农牧学院植物科学学院,西藏林芝 860000
摘要：[目的]全面了解多倍体猕猴桃种质资源的染色体倍性和基因组特征,并分析其在猕猴桃属植物中的系统进化关系,以期为多倍体猕猴桃全基因组组装提供参考.[方法]基于流式细胞术分析中华猕猴桃AcD2301(Actinidia chi-nensis)、软枣猕猴桃AcD2302(Actinidia arguta)、对萼猕猴桃AcD2303(Actinidia valvata)染色体倍性,利用Illumina二代测序平台开展基因组Survey分析,并基于SNP构建15种猕猴桃属植物系统进化树.[结果]中华猕猴桃AcD2301、软枣猕猴桃AcD2302、对萼猕猴桃AcD2303的染色体倍性分别为四倍体、四倍体、六倍体,与survey分析结果一致.K-mer分析预测中华猕猴桃AcD2301、软枣猕猴桃AcD2302、对萼猕猴桃AcD2303单套基因组大小分别约为626 Mb、668 Mb、585 Mb,杂合度为3.00％、3.30％、8.06％,重复序列比例为43.70％、45.30％、40.70％.系统进化树显示软枣猕猴桃与对萼猕猴桃亲缘关系较近,且均从中华猕猴桃独立进化而来.[结论]分析了中华猕猴桃AcD2301、软枣猕猴桃AcD2302、对萼猕猴桃AcD2303的染色体倍性、基因组大小和系统进化关系,为将来开展多倍体猕猴桃全基因组测序提供了参考,也为深入研究猕猴桃多倍化和系统进化提供了理论支持.
关键词：猕猴桃基因组survey分析基因组大小系统进化
分类号：S663.4(果树园艺)
资助基金：现代农业产业技术体系(2023;2023]4;CARS-26;2023]2-3;2024]026)
论文发表日期：2024-11-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 2214-2223 )
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