灰比诺葡萄病毒内蒙古分离物全基因组分析
郭孟泽
徐磊
闫雨婷
孙平平
张磊
李正男
内蒙古农业大学园艺与植物保护学院,呼和浩特 010018
摘要：[目的]获取灰比诺葡萄病毒(grapevine pinot gris virus,GPGV)内蒙古分离物全基因组序列,并对该病毒群体进行序列一致性、系统发育、基因重组以及群体遗传多样性等分析.[方法]以GPGV阳性样品为试验材料,通过RT-PCR技术和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification ofcDNA ends,RACE)克隆GPGV内蒙古分离物的全基因组序列,并通过分子生物学分析软件对其进行基因组序列分析.[结果]成果克隆了 2条GPGV内蒙古分离物(20IM-Vi-Vi1和20IM-ViVi2)的全基因组序列,序列全长均为7250 nt,且均编码3个ORFs;序列一致性分析结果显示,20IM-Vi-Vi1与20IM-ViVi2基因组序列核苷酸一致率为96.4％,与其他分离物的全基因组序列一致率分别为79.7％～96.8％、79.5％～97.7％;系统进化分析表明,GPGV所有全基因组分离物可划为4个分支,其中本研究中所获得的2个分离物20IM-ViVi 1与20IM-ViVi2均聚集在第Ⅰ分支,并均与中国夏黑分离物SRR2845691-GPGV亲缘关系最近;遗传多样性分析结果表明,GPGV具有较高的遗传多样性,其中GPGV亚洲分离物遗传多样性最高.[结论]首次获得GPGV内蒙古分离物的全基因组序列,并阐述了 2个GPGV内蒙古分离物与已知病毒之间的进化关系,可为中国GPGV株系划分、遗传进化研究奠定理论基础.
关键词：灰比诺葡萄病毒系统进化分析序列一致性遗传多样性
分类号：S663.1(果树园艺)S436.631(病虫害及其防治)
资助基金：内蒙古自治区科技计划项目(2022YFDZ0029)内蒙古自治区自然科学基金项目(2022QN03018)内蒙古自治区高等学校青年科技英才支持项目(NJYT23079)
论文发表日期：2024-12-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 2425-2435 )
英文信息