新疆甜瓜种质资源遗传多样性及果肉硬度性状GWAS分析
朱婉婷1
李江峰2
詹倩如3
耍振阳4
朱迎春5
郭艳霞2
骆翔6
1.哈密市农业农机技术推广服务中心,新疆哈密 839000;河南大学农学院,河南开封 4750002.哈密市农业农机技术推广服务中心,新疆哈密 8390003.信阳市农业科学院油料作物研究所,河南信阳 4640004.河南农业大学,郑州 4500025.中国农业科学院西部农业研究中心,新疆昌吉 8311006.河南大学农学院,河南开封 475000
摘要:[目的]甜瓜作为重要的全球性果蔬作物,果肉硬度等品质性状直接影响市场竞争力.旨在分析甜瓜种质资源遗传多样性和群体结构,定位果肉硬度相关基因.[方法]利用高通量测序技术对292份全球各地的甜瓜种质资源进行基因组分析,构建了一个大规模遗传变异图谱,并结合果肉硬度性状开展全基因组关联分析(GWAS)及单倍型分析.[结果]甜瓜种质群体可以分为地方品种(Pop1)和栽培品种(Pop2)两个主要分支,这两类品种在遗传多样性和群体结构上均存在显著差异.GWAS分析表明,在甜瓜8号染色体上存在与果肉硬度显著相关的SNP位点,该区域涉及多个细胞壁合成和重塑相关的候选基因,如肌醇单磷酸酶(MELO3C007440.2)和核苷酸-糖转运蛋白(MELO3C007449.2)等.这些基因可能通过调控果胶及细胞壁多糖的合成和重塑,从而影响果肉硬度.单倍型分析进一步揭示,硬质果肉与hap001单倍型密切相关,而软质或脆性果肉则与hap004单倍型显著关联.[结论]研究分析了新疆甜瓜种质资源遗传多样性,定位了甜瓜果肉硬度的候选基因,发掘了与果肉硬度相关的单倍型,为甜瓜果肉硬度及其他品质性状的遗传改良提供了新的分子标记,并为甜瓜分子标记辅助选择育种奠定了基础.
关键词:甜瓜全基因组关联分析果肉硬度
分类号:S651(瓜果园艺)
资助基金:河南省农业援疆项目(202107)新疆人才发展基金重点人才计划项目(XJARS-06-22)新疆维吾尔自治区重点研发计划项目(2023B02017-2)
论文发表日期:2025-05-10
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:14( 979-992 )
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