基于SSR标记的余甘子遗传多样性分析与核心种质构建
王建超
张小艳
张立杰
李韬
谢丽雪
福建省农业科学院果树研究所,福州 350013
摘要:[目的]利用SSR分子标记开展余甘子遗传多样性分析和核心种质构建研究,为余甘子种质资源保存、遗传育种和高效利用提供科学依据.[方法]利用余甘子SSR分子标记分析192份余甘子(Phyllanthus emblica Linn.)与1份近缘种小果叶下珠(Preticulatus Poir.)的遗传多样性和亲缘关系;从聚类方法、取样策略和取样比例筛选构建余甘子核心种质最佳方案,并检验其有效性.[结果]10对SSR引物在193个样本中共检测到85条多态性条带,多态信息含量0.77,余甘子遗传距离范围0~0.958 3,余甘子种质资源间的遗传分化水平高,多样性丰富.经聚类分析,192份余甘子可分为3个组别,相同生态分布区的种质亲缘关系相对较近.筛选出构建余甘子核心种质最佳方案为Jaccard遗传距离+类平均法+优先取样策略+10%取样比例,经检验,构建出的初级核心种质既有效排除了原种质遗传冗余,又确保了代表性和异质性.[结论]余甘子种质资源的遗传分化水平高,遗传多样性丰富;利用余甘子SSR多样性数据构建核心种质最佳方案为Jaccard遗传距离+类平均法+优先取样策略+10%取样比例,构建包含20份余甘子的核心种质,为种质资源收集保存及创新利用提供了科学依据.
关键词:余甘子简单重复序列遗传多样性核心种质
分类号:S667.9(果树园艺)
资助基金:科技部、财政部国家科技资源共享服务平台(NTPGRC2024-011)福建省属公益类科研院所专项(2022R1028004)福建省属公益类科研院所专项(2024R1027002)福建省人民政府-中国农业科学院农业高质量发展超越协同创新工程项目(XTCXGC2021019-GSS01)
论文发表日期:2025-08-10
在线出版日期:2025-09-04(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:15( 1672-1686 )
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果树学报

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CSTPCD北大核心CSCD
ISSN:1009-9980
年,卷(期):2025,42(8)
所属栏目:种质资源·遗传育种·分子生物学