猪FNDC5基因生物信息学分析及表达研究
黑伟
何志强
张燕伟
张万锋
蔡春波
杨阳
高鹏飞
郭晓红
曹果清
李步高
山西农业大学动物科学学院,山西 太谷 030801
摘要:本试验旨在扩增抗纤维连接蛋白Ⅲ型结构域蛋白5(Fibronectin TypeⅢDomain Containing Protein 5,FNDC 5)基因的编码序列(Coding Sequence,CDS),通过生物信息学软件分析FNDC5的特性,并分析该基因在晋汾白猪不同组织中的表达情况.选取1日龄晋汾白猪,以背最长肌cDNA为模板克隆FDNC5基因的CDS序列,利用生物信息学方法分析FNDC5的结构和功能,采用qRT-PCR检测FDNC5基因在晋汾白猪不同组织中的表达水平.结果表明,猪FDNC5基因的CDS序列有843 bp,共编码280个氨基酸.生物信息学预测,FNDC5为亲水性蛋白,二级结构中α螺旋、β转角、延伸链和无规则卷曲分别占31.79%、4.64%、20.36%和43.21%.qRT-PCR结果显示,FDNC5基因在肌肉、肝脏和心脏中高表达,在其他组织中的表达量较少.本研究结果为进一步探讨猪FDNC5基因的功能提供了参考依据.
关键词:FDNC5基因扩增表达
分类号:S813(普通畜牧学)
资助基金:三晋学者支持计划(2016)三晋学者支持计划(2017)基础研究项目(No.201901D211376)基础研究项目(201901D211369)
论文发表日期:2021-04-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 25-30 )
