基于RNA-seq不明原因复发性流产绒毛组织mRNA基因差异性表达研究
杨丽1
杨静2
叶尔登切切克3
韩锐3
腊晓琳4
1.830054 乌鲁木齐,新疆医科大学第一附属医院生殖医学中心;830054 乌鲁木齐,新疆医科大学第一附属医院生殖疾病与出生缺陷综合防治研究中心;830054 乌鲁木齐,新疆医科大学第一附属医院新疆生殖免疫临床医学研究中心2.新疆医科大学第五附属医院妇科3.830054 乌鲁木齐,新疆医科大学第一附属医院生殖医学中心4.830054 乌鲁木齐,新疆医科大学第一附属医院生殖医学中心;830054 乌鲁木齐,新疆医科大学第一附属医院生殖疾病与出生缺陷综合防治研究中心;830054 乌鲁木齐,新疆医科大学第一附属医院新疆生殖免疫临床医学研究中心;830054 乌鲁木齐,新疆医科大学第一附属医院省部共建中亚高发病成因与防治国家重点实验室
摘要：目的:构建不明原因复发性流产(unexplained recurrent spontaneous abortion,URSA)孕妇绒毛组织的mRNA差异性表达谱并进行功能分析,为阐明URSA的发生发展机制提供依据.方法:收集2022年3月于新疆医科大学第一附属医院妇科门诊收治的4例URSA(试验组)和4例选择性终止妊娠孕妇(对照组)的绒毛组织样本.应用转录组测序技术(RNA-seq)筛选2组差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并对其进行GO功能注释、KEGG通路分析及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,进一步研究差异表达mRNA的功能,并筛选出URSA的关键基因.结果:RNA-seq分析共筛选出3 350个DEGs,其中上调基因2 259个,下调基因1 091个.通过PPI网络分析,筛选出与 URSA 有关的前 10 个关键基因:TYROBP、CD74、GH1、GH2、STAT5A、HLA-DRA、STAT5B、HLA-DRB1、CISH 和HLA-A.通过GO和KEGG生物学功能分析,发现差异性表达的mRNA参与到多种白细胞分化相关免疫反应通路和同种异体免疫应答等生物学过程.结论:利用RNA-seq获得的URSA的mRNA差异性表达谱,筛选出可能与URSA有关的关键基因及生物学通路,为进一步研究URSA的发病机制和诊疗靶点提供了理论依据.
关键词：流产习惯性绒毛组织RNA信使转录组测序免疫调节
资助基金：新疆维吾尔自治区自然科学基金(2022D01C467)国家重点实验室开放基金(SKL-HID-CA-2020-JZ11)
论文发表日期：2024-06-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 322-328,341 )
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