西维因单链抗体同源建模及与西维因对接模拟研究
何扩1
张秀媛2
杜欣军3
王俊平3
周晓楠3
1.天津科技大学教育部食品营养与安全重点实验室,天津300457;河北北方学院,河北张家口0750002.河北北方学院,河北张家口0750003.天津科技大学教育部食品营养与安全重点实验室,天津300457
摘要:抗体的结构决定其功能,由于目前没有西维因抗体结晶结构的解析导致其与抗原结合机理不清楚,严重影响ELISA检测技术中对抗体特异性能的改造.本研究应用分子模拟与对接技术预测西维因单链抗体的三维结构及其与西维因分子的结合模式,采用同源建模方法首先获得西维因单链抗体的三维结构,然后采用分子对接技术将三维结构模型与西维因分子进行对接.结果表明,结合过程中H-CDR2、H-CDR3和L-CDR2形成一个疏水型的凹槽,疏水型的凹槽助推西维因分子与之结合并将西维因分子牢固地卡在里面,可能的结合位点由Ala51、Ser52、Ile51、Gly54、Ser56、Arg98、Gly100等氨基酸残基组成.为深入认识西维因分子与其抗体相互作用机理提供了理论指导,并为下一步西维因单链抗体体外亲和力的成熟奠定基础.
关键词:西维因单链抗体西维因同源建模分子对接
论文发表日期:2014-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
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现代食品科技

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北大核心CSTPCDEI
年,卷(期):2014,30(6)
所属栏目:基础研究