食源性单核细胞增生李斯特菌CRISPR结构的研究
狄慧玲1
闫鹤2
石磊1
1.华南理工大学轻工与食品学院,广东广州5106402.华南理工大学轻工与食品学院,广东广州510640;辽宁省食品安全重点实验室,辽宁锦州121013
摘要：为探明河北省2177份零售食品样本中检出的18株谱系I(血清型1/2b,4b)菌株的CRISPR序列结构,用PCR方法扩增了其CRISPR序列,采用生物信息学方法进行序列同源性分析,并根据在18菌株中CRISPR结构的阵列排布进行聚类分型研究.结果表明:18株菌共检出三类CRISPR序列排布(CRSIPR array:locus1,2,3).CRISPR locus1是一退化残基,repeat序列保守性差,spacer数量少.locus2和locus3是新掺入的,结构完整,活力旺盛,repeats序列保守,spacer数量增长迅速.locus1最普遍(13/18);有5株serotype 1/2b的菌株检出至少两个活性loci(locus2和locus3)中的一个,在serotype 4b菌株中未检出.总计,基因组中具有3个CRISPR loci的有2株,具有2个的有3株,仅有1个的有8株,无该结构的有5株.根据CRISPR array的排布共将18株菌聚类分型为5簇,4个亚簇,能较好的对1/2b血清型的菌株进行分型研究.该免疫防御系统的插入,增强了高致病性谱系Ⅰ菌株对环境的适应能力,增大了消除食品加工销售过程中该类菌株的难度,给食品安全造成更大威胁,因此相关部门应加强对该特征菌株的监管力度.
关键词：单核细胞增生李斯特菌规律成簇的串联重复序列谱系血清型
资助基金：国家科技支撑计划(2012BAD28B09;2014BAD13B00)
论文发表日期：2014-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
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