酸土脂环酸芽孢杆菌Fe-SOD基因克隆及生物信息学分析
焦凌霞
华承伟
徐茜茜
王俊杰
赵瑞香
1.河南科技学院食品学院,河南新乡,4530032.河南科技学院食品学院,河南新乡,4530033.河南科技学院食品学院,河南新乡,4530034.河南科技学院食品学院,河南新乡,4530035.河南科技学院食品学院,河南新乡,453003
摘要:酸土脂环酸芽孢杆菌具有嗜酸耐热的独特生理特性,从该属细菌中分离到的多种酶类都具有耐酸热稳定性,是筛选耐酸耐热酶的重要菌种资源.超氧化物歧化酶(SOD)由于具有重要的生理功能而广泛用于食品、药品及化妆品等行业.为了深入探讨酸土脂环酸芽孢杆菌SOD的分子生物学特性,本研究利用同源克隆、交错式热不对称PCR技术和生物信息学方法进行Fe-SOD基因克隆、测序及序列分析.结果表明,Fe-SOD基因(GenBank序列号:JN614998)ORF全长为606 bp,编码202个氨基酸,其推测氨基酸序列与来源于酸热脂环酸芽孢杆菌DSM 446的Fe-SOD(ACV58017.1)序列相似性最高,为78%.整个蛋白序列含有Fe/MnSODs家族的5个模体,SOD活性中心合有金属离子结合配基His27、His82、Asp164和His168,具有Fe/MnSODs家族典型的蛋白结构特征.酸土脂环酸芽孢杆菌Fe-SOD基因的克隆和生物信息学分析为进一步构建原核表达载体、获得生产耐酸热Fe-SOD的基因工程菌株奠定基础.
关键词:酸土脂环酸芽孢杆菌Fe-SOD基因克隆生物信息学
资助基金:河南省基础与前沿技术研究计划项目(142300410137)河南省高等学校青年骨干教师资助计划项目(2011GGJS-131)
论文发表日期:2015-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
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现代食品科技

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北大核心CSTPCDEI
年,卷(期):2015,31(3)
所属栏目:基础研究