变形假单胞菌2-酮基葡萄糖酸转运蛋白基因的克隆与分析
孙文敬1
栾方2
王大明3
张晓飞2
崔凤杰1
李运哲2
1.江苏大学食品与生物工程学院,江苏镇江212013;百勤异VC钠有限公司,江西德兴3342212.江苏大学食品与生物工程学院,江苏镇江,2120133.百勤异VC钠有限公司,江西德兴334221;江南大学生物工程学院,江苏无锡214122
摘要：该研究旨在克隆变形假单胞菌JUIM01的2-酮基葡萄糖酸转运蛋白基因kguT,并明确其基本的生物学信息.根据已报道的假单胞菌的基因组信息及其2-酮基葡萄糖酸操纵子的物理图谱设计简并引物,采用TD-PCR技术从变形假单胞菌中克隆到全长为1278bp的kguT,其核苷酸序列与Pseudomonas sp.CCOS191的编码2-酮基葡萄糖酸转运蛋白(KguT)的核苷酸序列的一致性为87％,编码一个由425个氨基酸残基组成的蛋白.该蛋白与Pseudomonas sp.Ml的KguT在氨基酸序列上的一致性达90％,定位于细胞膜,是一个具有12个跨膜结构的疏水性的跨膜蛋白,无信号肽,其二级结构中α螺旋、延伸链和无规卷曲所占的比例分别为75.76％、2.12％和22.12％.本研究首次从2-酮基葡萄糖酸的工业生产用菌中克隆到基因kguT,并对其进行了生物信息学分析,为变形假单胞菌的KguT的功能研究奠定了基础.
关键词：变形假单胞菌2-酮基葡萄糖酸转运蛋白kguT基因克隆生物信息学
资助基金：国家自然科学基金(31571885)国家高技术研究发展计划（863计划）(2012AA022103)江苏大学研究生科研创新计划(KYXX_0046)江苏大学大学生科研立项项目(13A083)
论文发表日期：2016-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
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