地黄环烯醚萜合成后修饰相关基因的挖掘与分析
朱畇昊
赵乐
董诚明
郑晓珂
冯卫生
1.河南中医学院药学院,河南中医学院呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心,河南郑州4500462.河南中医学院药学院,河南中医学院呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心,河南郑州4500463.河南中医学院药学院,河南中医学院呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心,河南郑州4500464.河南中医学院药学院,河南中医学院呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心,河南郑州4500465.河南中医学院药学院,河南中医学院呼吸疾病诊疗与新药研发河南省协同创新中心,河南郑州450046
摘要：本研究采用lllumina HiSeq 2500技术对地黄脱毒苗进行转录组测序,获得了地黄转录组信息,并对构建好的地黄基因Unigene库进行蛋白功能注释、KEGG代谢通路分析等生物信息学分析,以期大规模挖掘与地黄环烯醚萜类成分生物合成及后修饰相关的基因.应用高通量测序技术对地黄组培苗进行转录组测序,得到13.61Gb的干净数据,De novo组装后共获得70778条Unigene,其中33.428(47.23％)条unigenes能被Nr、Swiss-Prot、Pfam、KOG、KEGG、GO和COG等公共数据库注释.进一步对被注释的地黄萜类生物合成及后修饰相关基因进行挖掘发现,地黄转录组中共有81个Unigene参与萜类骨架合成;共有226个Unigene可能参与CYP450介导的环烯醚萜骨架的氧化修饰;共有102个Unigene与糖基转移酶相关.地黄转录组数据库的获得为探索地黄环烯醚萜类成分的生物合成研究奠定了基础,为后续基因功能的分析等研究提供分子水平依据.
关键词：转录组地黄细胞色素氧化酶p450糖基转移酶
资助基金：国家自然科学基金(81603232)国家科技支撑计划(2011BAI06802)河南省高等学校重点科研项目(15A360036)河南中医学院博士科研基金(BSJJ2011-07)河南省科技攻关计划(122101310400)
论文发表日期：2016-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
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