植物乳杆菌及其近缘种部分看家基因的系统发育分析
乌日拉嘎1
徐海燕1
宋宇琴1
冯淑贞1
孙志宏1
斯琴巴特尔2
包英姝2
张和平1
孟和毕力格1
1.内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室,内蒙古呼和浩特,0100182.锡林郭勒盟蒙医研究所,内蒙古锡林浩特,026000
摘要：本文研究了16S rRNA基因、pheS和pyrG部分基因序列对Lactobacillus plantarum(L.plantarum)及其近缘种的区分能力,采用分离自酸面团、酸牛奶和泡菜中的10株L.plantarum为研究对象,以其看家基因pheS和pyrG部分基因序列作为分子标记,结合已上传至GeneBank的近缘种的相应序列构建系统发育树并与以16S rRNA基因构建的系统发育树进行比较.结果表明:基于16SrRNA基因序列不能区分L.plantarum及其近缘种,而看家基因pheS和pyrG部分基因序列能够很好的区分植物乳杆菌种及其近缘种,其中,pheS在植物乳杆菌种内分型时相较于pyrG基因效果更好,以及将pheS和pyrG部分基因序列串联使用后,试验菌株与参考菌株的分类关系更加明晰,因此,联合基因(pheS-pyrG)可作为16S rRNA基因的辅助工具用于L.plantarum及近缘种和植物乳杆菌种内分型的快速分类鉴定.
关键词：植物乳杆菌系统发育分析16S rRNA基因
资助基金：国家科技重大专项(20140125)中国农业研究体系(CARS-37)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
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