四种基因定量方法对实时荧光PCR与微滴式数字PCR检测霍乱弧菌基因表达量的分析
唐静1
贾俊涛1
赵丽青1
王静2
张健1
姜英辉1
徐彪1
王昌军1
马云1
1.山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心食品农产品检测中心,山东青岛,2660022.威海出入境检验检疫局,山东威海,264205
摘要:基因表达量测定对基因功能解析和探索生命机理具有重大意义,目前实时荧光PCR和微滴式数字PCR技术是进行基因表达量测定的有效方法.本文以低温处理的霍乱弧菌sf、vcc、RecA、hly及16S rRNA基因为研究对象,分别用实时荧光PCR和微滴式数字PCR技术对低温处理前后霍乱弧菌的上述基因表达量进行测定,实时荧光PCR实验数据分别采用AACT和geNorm法进行分析,微滴式数字PCR实验数据分别采用相对定量和绝对定量法进行分析,获得处理组基因表达量相对于对照组的变化倍数;使用多维尺度法来分析四种基因定量方法的数据.结果表明,在本实验条件下,四种基因定量方法的分析结果存在差异;16S rRNA基因表达量发生了变化,不适合作为内参基因;微滴式数字PCR能更直观的给出基因表达量变化的结果,并且基因表达差异相对定量分析的准确度更高.
关键词:基因表达实时荧光定量PCR微滴式数字PCR
资助基金:国家质检总局科研项目(2012IK305)国家质检总局科研项目(2013IK175)国家质检总局科研项目(2014IK114)
论文发表日期:2017-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 93-98,80 )
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