GH78家族真菌α-L-鼠李糖苷酶分子系统进化关系分析
巩建业
吴喆瑜
李利君
倪辉
1.集美大学食品与生物工程学院,福建省食品微生物与酶工程重点实验室,福建厦门3610212.集美大学食品与生物工程学院,福建省食品微生物与酶工程重点实验室,福建厦门3610213.集美大学食品与生物工程学院,福建省食品微生物与酶工程重点实验室,福建厦门3610214.集美大学食品与生物工程学院,福建省食品微生物与酶工程重点实验室,福建厦门361021
摘要：为了分析糖苷水解酶第78家族(glucoside hydrolase family 78,GH78)中真菌α-L-鼠李糖苷酶保守区及进化关系,本研究应用ClustalW2软件对87条GH78家族真菌α-L-鼠李糖苷酶进行多重序列比对,利用Block Maker进一步分析,得到了该家族真菌的共有完全氨基酸保守位点及保守区;利用SignalP 4.1 Server对序列进行信号肽预测;应用MEGA 6.0软件对ClustalW2结果进行遗传距离分析并构建分子系统进化树.GH78家族真菌87条序列虽然长度不等,但均包含AHGWSTGPTY、VTLDTGQNVAG和NELSIPTDGAKRD3个保守区及多个完全保守氨基酸位点;87条序列中29条含有信号肽;属间遗传距离为0.7～48.5,种间遗传距离为0.4～48.5;分子系统进化树并不是依靠菌株来源进行聚类,而是依据是否为胞外酶进行聚类.该研究分析了GH78家族真菌α-L-鼠李糖苷酶的保守区及进化关系,为α-L-鼠李糖苷酶的工程改造奠定了基础.
关键词：α-L-鼠李糖苷酶保守区分子系统进化进化树
资助基金：国家自然科学基金(31371751)福建省农业高校产学合作重大项目(2014N5010)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 13-20 )
英文信息