副溶血弧菌菌株229基因组测序及其致病因子的注释
林毅英1
潘力1
吴清平2
王斌1
1.华南理工大学生物科学与工程学院,广东广州,5100062.广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室,广东广州,510070
摘要：本文对从冰冻海鱼中分离到的副溶血弧菌菌株229进行基因组测序,并对注释的基因进行功能聚类分析,以分析其致病因子,为研究其致病机制提供基因组全局水平的数据支持.完成了副溶血弧菌菌株229的基因组测序及组装,所得基因组4.97 Mb,GC含量为43.90％.基因注释获得4940个蛋白质编码基因(CDS),其中1304个CDS具有GO功能注释.WEGO注释显示大量CDS对于副溶血弧菌入侵宿主及随后的代谢过程发挥重要作用.获得了与副溶血弧菌致病性相关的致病因子,包括溶血素(hemolysin)、Ⅲ型因子(Type Ⅲ secretion system,TTSS),这些因子位于不同的染色体位点,形成独立的致病因子簇.副溶血弧菌菌株229基因组组装和功能注释为研究副溶血弧菌致病性的遗传学基础提供了有价值的数据.
关键词：副溶血弧菌基因组测序致病因子功能注释
资助基金：广东省科技计划(2016A050503016)广东省科技计划(2016A010105004)中央高校基本科研业务费专项华南理工大学项目(2015ZP032)广东省自然科学基金(2017A030313097)广东省自然科学基金(S2012030006235)
论文发表日期：2018-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 76-80 )
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