1-脱氧野尻霉素与糖代谢酶相互作用的分子动力学计算
李林1
周虹2
唐忠海1
苏小军3
李清明1
郭时印1
1.湖南农业大学食品科技学院,湖南长沙,4101282.湖南农业科学院作物研究所,湖南长沙,4101253.湖南农业大学食品科技学院,湖南长沙 410128;湖南省作物种质创新与资源利用重点实验室,湖南长沙 410128
摘要：1-脱氧野尻霉素(DNJ)是从桑叶中发现的一种天然生物碱,由于其结构与葡萄糖相似,可竞争性抑制糖苷酶活性,从而显著降低多糖的降解水平.本试验采用分子对接和分子动力学模拟方法,从PTP1B、PPARα、PPARy、α-淀粉酶(α-Amylase)和α-葡萄糖苷酶(α-Glucosidase)等蛋白中确定了DNJ的作用靶标,并阐明其作用模式.结果表明,α-Glucosidase与DNJ的结合力有绝对优势,进一步的氢键分析和能量分解结果表明,Glu268、Asp330和Asp199是关键残基,在DNJ与α-葡萄糖苷酶结合中有重要作用,其作用方式是形成稳定的氢键作用,静电力作用和极性溶剂化能是主要的结合力来源.DNJ小分子通过与上述关键残基的作用稳定结合在α-葡萄糖苷酶口袋内部,从而抑制α-葡萄糖苷酶的生物活性,发挥降血糖作用.上述研究从分子结构层面阐明了DNJ和α-Glucosidase的作用模式,为基于DNJ结构进行理想药物的设计和小分子数据库的虚拟筛选提供了参考.
关键词：1-脱氧野尻霉素分子对接分子动力学模拟
资助基金：湖南省教育厅科学研究项目(14B091)
论文发表日期：2018-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 143-148,243 )
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