分子动力学模拟与热稳定性实验相结合分析乙酰氨基葡萄糖与脂肪酶的相互作用机制
郑敦锦1
沈锐锋2
何康平2
罗佳伟2
陈胤熹2
黄嘉惠3
余洁婷2
郑少鹏2
古伟明4
曹诗林1
1.佛山科学技术学院食品科学与工程学院,广东佛山 528225;广东省食品智能制造重点实验室,佛山科学技术学院,广东佛山 5282252.佛山科学技术学院食品科学与工程学院,广东佛山 5282253.华南农业大学食品学院,广东广州 5106404.佛山科学技术学院食品科学与工程学院,广东佛山 528225;广东工业大学轻工化工学院,广东广州 510006
摘要：该研究采用分子动力学模拟方法研究南极假丝酵母脂肪酶B(CaLB)与乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc)的相互作用,以及通过热稳定性实验论证GlcNAc对CaLB的保护效果.结果表明:在323.15 K下,CaLB与GlcNAc的静电势能与Lennard-Jones(L-J)在前20 ns模拟时间中显著下降,CaLB-250 mmol/L-GlcNAc模型在0～100 ns时,静电势能和L-J势能分别下降了3350 kJ/mol和2791 kJ/mol,二者间的氢键数从0增加到115左右,CaLB与GlcNAc的可及面积(SASA)接近于50 nm2.均方根偏差(RMSD)和均方根波动(RMSF)数据表明:游离酶(Free-CaLB)模型在323.15 K和353.15 K下的RMSD分别为0.2617 nm和0.3473 nm,而不同浓度CaLB-GlcNAc模型的RMSD均小于Free-CaLB的数值,且CaLB-GlcNAc组装体模型区域(Val 147-Leu 155)波动明显小于Free-CaLB模型,说明GlcNAc可以减弱Free-CaLB的韧性而有效维持脂肪酶的原始结构.热稳定性实验表明:Free-CaLB及CaLB-GlcNAc在60℃下处理2.0 h,Free-CaLB的残余酶活力仅为22.26％,而CaLB-GlcNAc的残余酶活力为52.11％.综上,乙酰氨基葡萄糖可以提高游离脂肪酶的热稳定性.
关键词：南极假丝酵母脂肪酶B乙酰氨基葡萄糖分子动力学模拟热稳定性
资助基金：广东省基础与应用基础研究基金佛山市联合基金(粤佛联合基金)青年基金项目(2019A1515110621)广东普通高校青年创新人才项目(2017KQNCX217)佛山科学技术学院高层次人才启动项目(GG07016)广东省科技创新战略专项资金项目(pdjh2020b0627)广州无远生物科技有限公司-企业科研基金(012319705010)佛山科学技术学院研究生自由探索基金项目(2020ZYTS33)
论文发表日期：2022-03-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 74-81 )
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