枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA的生物信息学分析
黎菁菁1
赖昕珏2
李鑫尧2
马俊炜2
余铭怡2
罗佳伟2
陈胤熹2
余洁婷2
郑少鹏2
郑敦锦1
曹诗林1
陈宛涓3
1.佛山科学技术学院广东省食品智能制造重点实验室,广东佛山528000;佛山科学技术学院食品科学与工程学院,广东佛山5280002.佛山科学技术学院食品科学与工程学院,广东佛山5280003.佛山科学技术学院材料科学与氢能学院,广东佛山528000
摘要：该研究应用生物信息学方法对枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA进行分析,旨在为LipA的后续研究奠定一定的理论基础.采用一系列在线网站或软件对LipA的一级结构、亲疏水性、基本特性、二级结构、特殊卷曲螺旋、模体以及富含脯氨酸(P)、谷氨酸(E)、丝氨酸(S)和苏氨酸(T)的PEST序列等进行预测和分析,并对三级结构进行同源建模,对其表面电位、可及性分布以及Ramachandran图等进行分析.枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA是一种由212个氨基酸组成的稳定的脂溶性蛋白质,其亲、疏水性最强的区域分别为Lys75～Asn81和Val9～Leu17;不存在稳定的二聚体、三聚体卷曲螺旋和非PEST序列;有3种可能参与不同的生化反应的模体;有5段α-螺旋、6段β-折叠的α/β 类蛋白;整体呈弱正电势;LipA的可及性和Ramachandran图表明建模得到的三维结构是合理、可靠的.该研究为后续对枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA的分子设计和改造提供了 一定的理论基础.
关键词：枯草芽孢杆菌脂肪酶LipA生物信息学同源建模
资助基金：广东省基础与应用基础研究基金佛山市联合基金(粤佛联合基金)青年基金项目(2019A1515110621)广东省基础与应用基础研究基金佛山市联合基金(粤佛联合基金)青年基金项目(2019A1515111049)广东普通高校青年创新人才项目(2017KQNCX217)佛山科学技术学院高层次人才启动项目(GG07016)广东省科技创新战略专项资金项目(pdjh2020b0627)广东省科技创新战略专项资金项目(pdjh2022b0550)佛山科学技术学院实验室开放创新基金(2022No.005)
论文发表日期：2022-07-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 113-119,10 )
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