基于转录组学分析驴油生酮饮食下CT26+结肠癌肿瘤的变化
张华宸1
张宁2
邢敬亚3
谢兰1
祁兴震1
路侹1
程杰4
李兰杰1
刘桂芹1
1.聊城大学农学与农业工程学院,山东省黑毛驴高效繁育与生态饲养工程技术研究中心,山东省驴产业科技协同创新中心,山东聊城 2520592.聊城大学生物制药研究院,山东聊城 2520593.内蒙古农业大学动物科学学院,内蒙古自治区马属动物遗传育种与繁殖学重点实验室,内蒙古农业大学马属动物研究中心,内蒙古呼和浩特 0100184.东阿阿胶股份有限公司,山东聊城 252200
摘要：该研究旨在通过转录组测序技术筛选出驴油生酮饮食(Donkey Oil Ketogeni Diet,DOKD)影响CT26+结肠癌肿瘤生长的相关基因,挖掘对DOKD响应的基因及其代谢通路,为解析驴油生酮饮食抑制肿瘤生长的机制提供依据.该研究选取一致性较好的CT26+结肠癌BALB/c模型小鼠,随机分为2组,每组3个重复,分别饲喂驴油生酮饮食(DOKD)与正常饮食(ND).饲喂10 d后处死摘取肿瘤组织,测量肿瘤的质量及体积,并利用RNA-Seq技术和生物信息分析方法进行转录组测序及结果分析.DOKD组与ND组小鼠体质量无显著差异,肿瘤明显小于ND组.与ND组相比,DOKD组共18个基因差异表达,其中12个DEGs上调,6个DEGs下调.这些DEGs注释到170条GO条目,其中生物过程(BP)类别124条,细胞组成(CC)类别2条,分子功能(MF)类别44条;涉及18条KEGG通路,主要富集在IL-17信号通路、趋化因子信号通路、细胞因子受体相互作用信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等重要通路.此外,该研究通过Western blot进一步研究了TLR4/NF-κB信号通路在在肿瘤中的作用.综上,DOKD对CT26+结肠癌肿瘤有明显抑制作用,该作用可能与IL-17信号通路、趋化因子信号通路、细胞因子受体相互作用信号通路、TNF信号通路等通路密切相关.
关键词：驴油生酮饮食肿瘤转录组学CT26+结肠癌
资助基金：山东省现代农业产业技术体系驴产业创新团队项目(SDAIT-27)山东省乡村振兴科技创新提振行动计划项目(2021TZXD012)聊城大学博士科研启动项目(318052120)聊城大学畜牧学学科开放课题(319312101-03)
论文发表日期：2023-06-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 18-26 )
英文信息