计算机模拟纳豆源多肽与DPP-Ⅳ和SARS-CoV-2Mpro的相互作用
曾巧辉1
郭槟勇1
高立芳1
黄燕燕1
王敬敬1
曾新安2
彭名军3
1.佛山科学技术学院食品科学与工程学院,广东省食品智能制造重点实验室,广东佛山 5282252.佛山科学技术学院食品科学与工程学院,广东省食品智能制造重点实验室,广东佛山 528225;华南理工大学食品科学与工程学院,广东广州 5106403.广州市食品检验所,广东广州 511400
摘要:兼具糖尿病的新型冠状病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19)患者病死率明显偏高,抑制Ⅱ型糖尿病关键酶二肽基肽酶 4(DPP-Ⅳ)和新冠肺炎病毒主蛋白酶(SARS-CoV-2 Mpro)的活性能缓解相应的病症.该研究采用UniProt、NCBI和PDB数据库检索纳豆蛋白,基于BIOPBP-UWM数据库开展计算机模拟胃肠道蛋白酶(胃蛋白酶、胰蛋白酶和胰凝乳蛋白酶)水解纳豆蛋白的研究,最后利用分子对接技术分别研究纳豆蛋白源多肽与DPP-Ⅳ和SARS-CoV-2 Mpro的结合能力,分析参与相互作用的氨基酸残基与分子作用力类型.结果发现,糖转运蛋白与两种酶具有良好的结合效果.特别地,序列为ISQPR、TIPVR和STVTR的多肽对两种酶都具有较高的结合分数(≤-130),被鉴定为DPP-Ⅳ和SARS-CoV-2 Mpro的双重抑制肽.因此,纳豆蛋白具有缓解Ⅱ型糖尿病病症和作为新型冠状病毒感染病人营养补充剂的潜力.
关键词:二肽基肽酶-Ⅳ新冠肺炎主蛋白酶纳豆蛋白营养补充
资助基金:广东省科技创新战略专项(2022B1212010015)广东省基础与应用基础研究基金(2020A1515110326)广东省市场监督管理局科研攻关项目(2022CS01)广东省教育厅特色创新项目(2022KTSCX120)
论文发表日期:2023-06-15
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:12( 142-153 )
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