树莓RiPAL1基因克隆及生物信息学分析
孙华军
刘盈
李雪静
杨斯琪
钱丽丽
李跃
黑龙江八一农垦大学食品学院,黑龙江大庆 163316
摘要：苯丙氨酸解氨酶(Phenylalanine Ammonia Lyase,PAL)是苯丙烷类代谢的关键酶,能调节树莓中黄酮类的生物合成.为了深入研究树莓中RiPAL1 基因的功能与调控机制,以树莓果实为材料提取总RNA,合成cDNA第一链,然后成功克隆出树莓果实RiPAL1基因,并对其进行了相关的生物信息学分析.结果表明,RiPAL1基因的编码序列(Coding Sequence,CDS)全长为2 133 bp,编码710个氨基酸,分子量为77.50 ku,等电点为6.21.RiPAL1蛋白疏水性最大值为4.50,最小值为-4.50,平均疏水指数为-0.49,为亲水性蛋白,无跨膜结构,无信号肽.含有4个N糖基化位点和67个特异性激酶位点,二级结构以α螺旋为主,三级结构为同型四聚体.多序列比对显示RiPAL1蛋白具有典型的苯丙氨酸解氨酶保守结构域,系统进化分析表明RiPAL1蛋白与同科植物草莓亲缘关系最近.该研究可为深入研究RiPAL1基因参与树莓果实黄酮类物质生物合成的分子机制提供参考.
关键词：树莓苯丙氨酸解氨酶(PAL)基因克隆生信分析黄酮
资助基金：黑龙江省自然科学基金联合引导项目(LH2021C067)黑龙江八一农垦大学引进人才科研启动基金(XYB202102)黑龙江八一农垦大学大学生创新创业训练计划项目(S202210223002)
论文发表日期：2023-09-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 88-95 )
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