海洋链霉菌KR结构域基因的克隆与分析
薛永常
刘永亮
许佳
刘长斌
大连工业大学生物工程学院,辽宁大连 116034
摘要：酮还原酶(Ketoreductase,KR)是聚酮合酶(Polyketide Synthase,PKS)重要的组分,可催化β-酮基的还原,是手性药物合成的重要手段,并在聚酮化合物合成中起着关键性作用.该研究从海洋链霉菌 Streptomyces sp.X-66 基因组 DNA 扩增出一条1331 bp的KR结构域基因,并进行生物信息学分析.Blast结果显示该序列包括了FAS KR和PKS KR两部分,核心功能区域集中于PKS KR基因部分序列;最大ORF区域拟编码333个氨基酸,理论等电点为4.80,分子式为C1500H2419N433O463S6,不稳定指数为24.85,为酸性稳定蛋白,并有较低亲水性,不含信号肽和跨膜结构,二级结构以 α-螺旋和无规卷曲为主,SDS-PAGE 显示其相对分子质量约为70 ku.通过氨基酸多序列比对,表明蛋白KR3属于B1型KR;以蛋白KR3氨基酸序列预测并检验其三级结构模型,利用分子对接和可视化分析预测蛋白KR3与配体结合的关键残基为 204Thr、206Thr和 207Leu,依据相关研究分析蛋白KR3引导底物进入活性中心的结合模式与B型KR较为符合,为进一步研究KR3的功能及新型手性药物和聚酮化合物的合成提供科学依据.
关键词：链霉菌KR结构域基因克隆分子对接生物信息学
资助基金：辽宁省教育厅高校基本科研项目(LJKMZ20220899)辽宁省自然科学基金(20180550858)
论文发表日期：2023-10-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 97-103 )
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