随机扩增多态性DNA分子标记技术在肠球菌分型中的应用
付竹贤1
关仁梅2
王淑敏2
陈偲1
罗璠1
1.西南民族大学青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部四川省重点实验室,四川成都 610041;西南民族大学畜牧兽医学院,四川成都 6100412.西南民族大学畜牧兽医学院,四川成都 610041
摘要：该研究旨在探索随机扩增多态性DNA(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD)分子标记技术在肠球菌种间快速分型的效果.试验通过筛选模板、单引物、双引物及RAPD反应体系,构建肠球菌种间分型体系,对32株已知肠球菌分型确定分型相似度标准,并通过对46株未知肠球菌进行种间分型以及管家基因rpoA测定验证分型效果.结果显示微波法提取基因组DNA满足实验需要,筛选出7条单引物用于双引物配对组合,最适的双引物反应体系为:2×PCR Taq Mix 12.5 μL,模板DNA 1 μL,引物各1 μL,ddH2O 9.5 μL;分型效果最好的双引物组合为 Primer1+Primer5,该引物组合可以在 80%的相似度下区分肠球菌种间差异,Primer1+Primer3组合在500 bp位置扩增出海氏肠球菌的特征条带,可以作为海氏肠球菌的鉴定指标,用以快速鉴定海氏肠球菌.
关键词：肠球菌随机扩增多态性DNA双引物体系优化
资助基金：四川省自然科学基金面上项目(2022NSFSC0114)西南民族大学研究生创新型科研项目(CX2021SZ14)
论文发表日期：2023-11-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 86-93 )
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