计算机模拟筛选食用藻蛋白源PAR2抑制肽
高立芳1
曾新安1
金可沆1
范土贵1
彭名军2
曾巧辉1
1.佛山科学技术学院食品科学与工程学院,广东省食品智能制造重点实验室,广东佛山 5282252.广州市食品检验所,广东广州 511400
摘要：该研究主要是通过计算机模拟,从食品来源蛋白质中预测筛选具有蛋白酶激活受体2(Protease Activated Receptor 2,PAR2)抑制作用的生物活性肽,同时预测食用藻类蛋白质酶解后所得的肽段的生物活性、水溶性等理化指标.首先,利用NCBI数据库和蛋白质晶体数据库(Protein Data Bank,PDB)比对选择食用藻类蛋白质,其次通过BIOPEP-UWM数据库模拟酶解,Peptide Ranker进行活性分析,Innovagen和ToxinPred预测高活性肽,最后采用HPEPDOCK将获得的活性评分超过0.5、水溶性优且无毒的小分子活性肽与PAR2进行分子对接模拟,以探究两者之间的分子结合能力,进而分析判别不同小分子活性肽抑制PAR2活力的潜力和机制.结果表明,小分子寡肽PAGR(-165.80)、PAR(-163.93)、IDQW(-152.95)、DISAW(-154.48)与PAR2具有较高的结合分数,是PAR2潜在的活性抑制肽.该研究旨为藻类蛋白的开发利用以及PAR2抑制剂的挖掘研究提供参考.
关键词：食用藻蛋白生物活性肽蛋白酶激活受体2分子对接
资助基金：广东省科技创新战略专项(2022B1212010015)广东省基础与应用基础研究基金(2020A1515110326)广东省市场监督管理局科研攻关项目(2022CS01)广东省教育厅创新强校项目(2022KTSCX120)
论文发表日期：2023-12-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 158-168 )
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