脱水过程中无核白葡萄转录组测序及膜脂降解代谢中关键基因的筛选
马紫荆
马金花
常晨光
加依娜·牙森
黄文书
新疆农业大学食品科学与药学学院,新疆乌鲁木齐 830052
摘要:该研究以吐鲁番地区无核白葡萄为试验材料,在 25℃常温和 30℃热风干燥后,取失水 25%、50%时褐变和未褐变的样品.利用转录组测序技术筛选出膜脂降解代谢相关的关键基因,并利用实时荧光定量PCR技术对其进行验证,研究结果显示,转录组测序共获得了 11.63 亿的clean data,当无核白失水 50%时未褐变与褐变的相比,在快速脱水组筛选出 718 个差异表达基因,慢速脱水组 2 259 个.将上述基因进行GO功能富集和KEGG富集分析后,筛选出 43 个膜脂代谢相关的差异基因,归类于 5 种代谢途径.从已获得的差异基因中最终筛选出乙醛脱氢酶 7B4(Aldehyde Dehydrogenase7B4,ALDH7B4)、双半乳糖甘油二酯合成酶 1(Digalactose Diglycerol Synthetase1,DGD1)、脂氧合酶(Lipoxygenase,LOX)、磷脂磷酸水解酶 2(Lipid Phosphate Phosphatase2,LPP2)、二酰基甘油激酶 5(Diacylglycerol Kinase5,DGK5)、非特异性磷脂酶C4(Non-specific Phospholipase C4,NPC4)、磷脂酶Dα1(Phospholipase Dα1,PLDα1)7 个膜脂代谢相关的关键基因,经qRT-PCR验证,基因表达趋势与转录组测序结果基本一致.结果表明,膜脂降解代谢相关基因表达量变化对无核白脱水褐变有一定影响.
关键词:无核白转录组测序膜脂代谢实时荧光定量差异表达基因
资助基金:国家自然科学基金(32060546)
论文发表日期:2024-02-15
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:10( 81-90 )
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现代食品科技

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CSTPCD北大核心
ISSN:1673-9078
年,卷(期):2024,40(2)
所属栏目:生物工程