植物乳杆菌DMDL 9010胞外多糖合成蛋白cpsB的生物信息学分析
梁婉诗1
吴佳敏1
林嘉伟1
曹凯1
宋炜桐1
曾新安2
刘冬梅3
黄燕燕1
1.佛山科学技术学院食品科学与工程学院,佛山科学技术学院广东省食品智能制造重点实验室,广东佛山 5282252.佛山科学技术学院食品科学与工程学院,佛山科学技术学院广东省食品智能制造重点实验室,广东佛山 528225;华南理工大学食品科学与工程学院,广东广州 5106403.华南理工大学食品科学与工程学院,广东广州 510640
摘要：为了探讨植物乳杆菌DMDL 9010胞外多糖合成蛋白cpsB的结构特性,该文通过生物信息学技术研究了胞外多糖合成蛋白cpsB的理化性质、亲/疏水性、跨膜结构、功能位点、磷酸化位点、信号肽、结构域、保守功能域、序列同源性以及空间结构进行预测与分析.结果表明胞外多糖合成蛋白cpsB相对分子质量约为2 920,等电点6.86,含有191个氨基酸;其为疏水蛋白,具有较高的稳定性;经过跨膜结构预测,发现其不存在跨膜结构,为胞内蛋白;胞外多糖合成蛋白cpsB中含有15个磷酸位点;氨基酸序列中不包含信号肽,所编码蛋白均为内分泌型蛋白;保守功能域预测中,基因中仅发现一段PHP结构域,该基因可能参与调节胞外多糖的基因表达.胞外多糖合成蛋白cpsB的二级结构中α-螺旋占 51.14%,并不存在β-折叠和β-转角结构,其三级结构比例与二级结构基本相似.该研究对植物乳杆菌DMDL 9010 的胞外多糖合成蛋白cpsB功能机制进行深入研究,对利用基因工程技术研究其胞外多糖的生物合成具有重要意义.
关键词：植物乳杆菌胞外多糖合成蛋白cpsB生物信息学
资助基金：广东省基础与应用基础研究基金项目(2022A1515110426)广东省科技创新战略专项(2022B1212010015)佛山科学技术学院高层次人才经费(CGZ07001)企业委托项目(BKH208034)
论文发表日期：2024-03-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 113-120 )
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