转录组和代谢组联合分析揭示大叶黄精皂苷生物合成相关酶基因
崔泓实1
梁思琪1
石广地1
崔令军2
肖强2
1.生物资源保护与利用湖北省重点实验室,湖北 恩施 4450002.生物资源保护与利用湖北省重点实验室,湖北 恩施 445000;湖北民族大学 林学园艺学院,湖北 恩施 445000
摘要：为了丰富大叶黄精(Polygonatum kingianum var.grandifolium)根茎发育的转录组数据,发掘参与皂苷生物合成的功能基因,基于Illumina深度测序平台,对大叶黄精根茎进行转录组测序,并对次生代谢途径中皂苷的生物合成通路进行深入解析.结果显示,大叶黄精根茎的转录组数据经拼接后获得 198296 条转录本、92858 条基因序列.基于超高效液相色谱和串联质谱(ultra performance liquid chromatography-tandem mass spectrometry,UPLC-MS/MS)检测平台和自建数据库共检测到 238 种差异显著代谢物.根据大叶黄精皂苷合成途径中酶基因注释和差异基因的表达及代谢途径富集的分析,一共找到 3 条合成皂苷途径的相关通路以及 33 个酶基因,推测这些酶基因在皂苷合成途径中起关键作用.该研究为大叶黄精的转录组学和代谢组学研究提供了丰富的参考数据,对于大叶黄精的功能基因组学研究具有重要意义.
关键词：大叶黄精转录组学代谢组学Illumina深度测序平台超高效液相色谱皂苷生物合成途径
分类号：S567.2(经济作物)
资助基金：国家自然科学基金(31260057)湖北省科技厅技术创新重大专项项目(2019ACA120)湖北省自然科学基金(2023AFD077)
论文发表日期：2024-03-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 1-10 )
英文信息