野生大麦SOD基因家族生物信息学分析
高诚1
林一欣2
饶江雷1
覃英1
邓志军1
1.生物资源保护与利用湖北省重点实验室,湖北 恩施 4450002.中国农业科学院 作物科学研究所,北京 100081
摘要：为了探究野生大麦(Hordeum vulgare ssp.spontaneum(K.Koch)Thell.)的抗逆潜力,通过生物信息学方法对其超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)基因家族进行了全基因组水平的鉴定与分析.结果表明,野生大麦SOD基因家族共有 10 个成员,分属B1K CSD、B1K MSD、B1K FSD 3 个亚家族,分别有 7、1、2 个成员,不均匀分布在 5条染色体上,与大麦相比增加了Horvu FT11 3H01G447400、Horvu FT11 5H01G364600、Horvu FT11 5H01G368700 SOD基因.蛋白结构分析结果显示,野生大麦的SOD蛋白家族主要以无规则卷曲为主;同一蛋白亚家族成员的蛋白保守基序组成相似,在进化上相对保守,但基因结构差异较大.基因表达分析表明,在盐胁迫下,B1K CSD1、B1K CSD2、B1K CSD6、B1K CSD7、B1K FSD1、B1K FSD2、B1K MSD1 7 个基因的表达量发生了显著变化,在响应盐胁迫过程中起重要作用.野生大麦SOD基因家族的鉴定、分析对野生大麦SOD基因功能及盐胁迫响应机制研究具有一定的借鉴意义.
关键词：野生大麦超氧化物歧化酶基因家族系统发育分析基因表达
分类号：S512.3(禾谷类作物)
资助基金：国家自然科学基金(31860073)生物资源保护与利用湖北省重点实验室开放基金项目(KYPT012401)
论文发表日期：2025-03-19
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 1-6,17 )
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