糖尿病、冠状动脉疾病及两病并存患者基因表达差异分析
宫蕊1
热依拉·牙合甫2
张国亮3
任珊4
陈曼丽3
陈孟晖3
李海滨5
赵成6
1.050031 石家庄市,河北省儿童医院2.新疆医科大学第二附属医院3.河北省石家庄市第三医院4.河北省人民医院5.河北医科大学第三医院6.河北省石家庄市长安区谈固东区社区卫生服务站
摘要：目的 研究分析2型糖尿病(T2DM)、冠状动脉疾病(CAD)病理共有的关键调控基因及分子机制,并进一步分析上述2种疾病之间是否存在共有的调控基因,以期早诊断早干预.方法 对确诊2型糖尿病、冠状动脉疾病、同患两病患者及正常对照组的外周血单核细胞进行转录组测序(RNA-sequencing).利用基因本体论数据库(gene ontology,GO)进行功能富集分析;京都基因和基因组百科全书数据库(KEGG)进行通路富集分析.然后应用生物通用交互数据集库(BioGRID, 共计191个基因在2型糖尿病、冠状动脉疾病和两病共存条件下均差异表达;2型糖尿病特异性的蛋白质-蛋白质互作关系网络中,TCF4(Degree=169)、SKP1(Degree=164)、UBE2W(Degree=75)为枢纽蛋白;冠状动脉疾病特异性的蛋白质-蛋白质互作关系网络中,HIF1A(Degree=124)、SMAD1(Degree=112)和SKIL(Degree=94)为枢纽蛋白;通过GSE23561基因表达数据集对候选差异表达基因验证,其中HIF1A、SMAD1和SKIL三个基因在冠状动脉疾病中的表达水平均显著高于正常对照,HIF1A在2型糖尿病中显著下调.结论 共同差异表达基因主要参与病毒感染周期、抗凋亡、胰腺发育、先天免疫应答和凝血功能等生物功能和代谢通路.TCF4、SKP1与UBE2W为2型糖尿病的关键调控基因;HIF1A、SMAD1与SKIL为冠状动脉疾病的关键调控基因.冠状动脉疾病、2型糖尿病、2型糖尿病+冠状动脉疾病之间存在共有的调控基因,可能因其具有相似病理分子机制.
关键词：冠状动脉疾病2型糖尿病转录组测序差异表达基因
分类号：R587.1(内分泌腺疾病及代谢病)R543.3(心脏、血管（循环系）疾病)
论文发表日期：2020-05-25
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 1449-1455 )
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