小细胞肺癌潜在相关基因的生物信息学分析及功能预测
杨梦霞1
郭宵飞2
朱世杰2
芦殿荣2
王宁军2
1.100029 中国中医科学院望京医院肿瘤科;北京中医药大学研究生院2.100029 中国中医科学院望京医院肿瘤科
摘要:目的 对小细胞肺癌发生发展的关键基因和分子机制进行生物信息学分析,为诊疗提供潜在靶点和生物标志物.方法 从GEO数据库筛选小细胞肺癌基因表达数据集,并运用GEO2 R分析差异表达基因(DEG);再利用DAVID数据库对DEG进行富集分析,并构建蛋白互作网络图,进一步筛选出小细胞肺癌关键基因并进行预后分析.结果 筛选出614个DEG,其中上调基因328个、下调基因286个.富集结果显示,DEG的功能主要与微管运动、DNA修复、驱动蛋白复合物及微管结合等有关.根据蛋白互作网络中的节点连接度(Degree≥40),筛选出CDK1、BUB1和CCNB2等13个关键基因.预后生存分析发现,关键基因高表达水平与不良预后有关(P均<0.01).结论 CDK1、BUB1和CCNB2等13个关键基因可能是小细胞肺癌诊疗的潜在靶点和预后标志物.
关键词:小细胞肺癌生物信息学差异表达基因关键基因预后
分类号:R734.2(呼吸系肿瘤)
资助基金:国家自然科学基金(81973640)中国中医科学院望京医院院级课题(2060302)
论文发表日期:2023-01-25
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 165-169 )
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河北医药

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ISSN:1002-7386
年,卷(期):2023,45(2)
所属栏目:论著