基于基因测序技术分析肛瘘患者微小RNA的表达特点及功能
蔡涛1
李志2
冷羽2
张泰魏2
曹波2
吴雪峰1
景茂林1
张琪琦1
吴媛媛1
王雪亮1
李欢1
1.550000 贵阳市,贵州中医药大学2.贵州中医药大学第一附属医院肛肠科
摘要：目的 采用基因测序技术,检测肛瘘瘘管壁组织中异常表达的miRNA,并进一步分析相关信号通路的功能.方法 选择高位复杂性肛瘘患者 3 例均行手术治疗,取各患者手术切除的瘘管壁组织及瘘管壁远端正常组织形成自身配对对比,采用高通量测序技术筛选瘘管壁组织中差异表达的 miRNA并进行聚类分析.采用TargetScan、miRanda两个靶基因数据库,对差异表达的miRNA进行靶基因预测.最后再选取两个数据库交叉的靶基因进行GO和KEGG富集分析,预测靶基因参与的生物学过程及信号通路.结果 本研究共计筛选出20 个表达差异具有统计学意义的miRNA.通过靶基因预测,共计得到 85 510 个靶基因.进一步行GO富集分析结果提示:本研究得到的差异表达的 20 个miRNA靶基因所涉及的参与的生物过程主要包括:转移酶活性、调控转录、三磷酸腺苷结合、金属离子结合、DNA结合、核酸结合、核苷酸结合、细胞骨架、细胞投影、细胞连接、RNA聚合酶对转录的正调控作用、胞内信号转导等.通过KEGG富集分析显示,与本研究中差异表达的 20 个miRNA密切相关的信号通路主要包括癌通路、Ras、Rap1、PI3K-Akt、cAMP、MAPK、Hippo等通路.结论 肛瘘瘘管壁组织中特征性的miRNA主要参与细胞增殖、迁移、凋亡相关的信号通路,与创面愈合密切相关,这些通路可能成为临床促进肛瘘术后创面愈合的潜在治疗靶点.
关键词：肛瘘微小RNA信号通路靶基因
分类号：R657.16(外科学各论)
资助基金：国家自然科学基金(82160909)贵州省卫生健康委科学技术基金项目(gzwkj2023-169)
论文发表日期：2023-04-25
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 1131-1136 )
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