单细胞转录组联合蛋白质组学分析肝细胞癌的发病机制
王谨1
朱娟娟2
杨芳芳3
1.100015 北京市,首都医科大学附属北京地坛医院传染病研究所新发突发传染病研究北京市重点实验室北京市感染性疾病研究中心国家传染病医学中心首都医科大学附属北京地坛医院传染病溯源预警与智能决策全国重点实验室2.首都医科大学附属北京同仁医院北京市糖尿病研究所3.中国医学科学院阜外医院检验科
摘要：目的 通过单细胞转录组联合蛋白质组学分析,结合体内外实验,探索调节肝细胞癌进展的新颖机制,为肝细胞癌治疗提供新策略.方法 利用R语言对公开数据库中肝癌患者单细胞转录组及细胞模型蛋白质组数据进行重分析,筛选响应肝细胞癌微环境变化的关键细胞亚群,并结合小鼠皮下荷瘤模型及肿瘤细胞共培养,验证该细胞群体对肝细胞癌微环境的调控作用.结果 通过生物信息学分析发现肝癌微环境中巨噬细胞与细胞外基质的相互作用与肿瘤进展密切相关;体内及体外实验证实肿瘤相关巨噬细胞相较于非肿瘤浸润的巨噬细胞,与细胞外基质的主要成分胶原蛋白存在更强的相互作用;在荷瘤小鼠模型中,利用BAPN药物解聚细胞外基质,肿瘤生长受限,表现为肿瘤僵硬度降低、血管生成受抑制、骨髓来源抑制性细胞浸润减少(P＜0.05).结论 巨噬细胞-细胞外基质互作在调节肝癌微环境中发挥重要作用,靶向肿瘤细胞外基质重构或可成为肝细胞癌实体肿瘤治疗的新策略.
关键词：肝细胞癌单细胞测序蛋白质组肿瘤相关巨噬细胞细胞外基质
分类号：R735.7(消化系肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(32300658)北京市医院管理中心创新梦工场(202105)
论文发表日期：2024-09-25
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 2725-2731 )
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