基于免疫细胞单细胞测序的肝细胞癌预后模型的建立及验证
苏淼1
赵春华1
苗纯2
吴霞3
王丽华1
闫玉红1
1.053000 河北省衡水市人民医院消化内科2.053000 河北省衡水市人民医院信息中心3.河北省衡水市第三人民医院信息科
摘要:目的 分析肿瘤微环境中免疫细胞的单细胞测序(scRNA-seq)数据可筛选出决定肿瘤进展的生物标志物.本研究旨在构建一个基于免疫细胞单细胞测序的肝细胞癌预后模型.方法 从基因表达综合数据库下载并分析肝细胞癌免疫细胞的单细胞测序数据,获得差异基因,并筛选免疫相关差异基因.从癌症基因组图谱数据库下载肝细胞癌的转录组数据和临床资料.采用单因素Cox、LASSO和多因素Cox回归分析,从免疫相关差异基因中进一步筛选免疫相关预后基因,构建并验证预后模型.分析免疫相关预后基因与临床危险因素、免疫细胞浸润的相关性.最后进行功能富集分析.结果 下载了 1 506个肝细胞癌免疫细胞的单细胞表达数据,获得385个差异基因,筛选出67个免疫相关差异基因.下载了 367例肝细胞癌患者的表达数据及临床资料,筛选出3个免疫相关预后基因.免疫相关预后基因与多个临床特征相关,具有更强的预测能力,并独立于其他临床危险因素.免疫相关预后基因和免疫细胞浸润密切相关.功能富集分析显示3个免疫相关预后基因参与了肿瘤的多种免疫机制.结论 基于免疫细胞单细胞测序的肝细胞癌预后模型预准确性高,不仅反映了肿瘤微环境的免疫状态,也为患者预后提供了新的标志物.
关键词:肝细胞癌单细胞测序肿瘤微环境免疫相关基因预后
分类号:R735.7(消化系肿瘤)
资助基金:河北省医学科学研究课题计划项目(20232171)
论文发表日期:2025-10-26
在线出版日期:2025-11-19(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 1622-1627 )
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河北医药

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ISSN:1002-7386
年,卷(期):2025,47(10)
所属栏目:论著