基于生物信息学分析CERK基因在上皮性卵巢癌的预后价值
彭靓1
曹保娣2
陈洁2
王晓晖1
周景俭2
1.景德镇市第二人民医院,江西 景德镇 333000;景德镇市分子病理重点实验室,江西 景德镇 3330002.景德镇市第二人民医院,江西 景德镇 333000
摘要：目的:基于生物信息学评价CERK基因在上皮性卵巢癌中的预后意义.方法:通过GEO数据库和TCGA数据库下载并整理上皮性卵巢癌的基因表达谱数据及临床信息,使用R/Bioconductor中的limma包筛选GSE26712数据集中的差异表达基因,利用R包clusterProfiler对差异基因进行GO和信号通路富集分析,使用Cytoscape3.8.2筛选出hub genes并构建PPI网络.通过Kaplan-Meier曲线分析卵巢癌组织中CERK表达与患者总生存期预后的关系,GSEA富集分析CERK可能参与的信号通路,分别使用线软件和Targetscan、miRWalk、miRDB数据库预测CERK的转录因子和miRNAs.使用RT-qPCR检测CERK基因在上皮性卵巢癌及其癌旁组织的表达情况.结果:GSE26712数据集获得上皮性卵巢癌差异表达基因1 535个,其中下调基因945个,上调基因590个.KEGG分析发现,差异表达基因主要富集在P13K-Akt、Ras、Rap1等通路中.筛选出关键基因共20个,包含CERK.CERK的表达与上皮性卵巢癌患者的生存率有关,且是影响上皮性卵巢癌的独立预后因素.GSEA富集分析发现CERK与肿瘤的迁移、侵袭等有关.预测到调控CERK的转录因子和miRNAs分别为31个和46个,其中,miR-187的表达与卵巢癌的预后密切相关.相对癌旁组织,上皮性卵巢癌中CERK基因表达上调.结论:CERK与上皮性卵巢癌的预后密切相关,其功能可能是促进肿瘤的迁移、侵袭.CERK有望成为上皮性卵巢癌患者的重要预后因子.
关键词：上皮性卵巢癌CERK基因表达分析预后分析miR-187
分类号：R737.31(泌尿生殖器肿瘤)
资助基金：江西省卫生健康委科技计划项目(202140405)景德镇市科技局计划项目(20224PTJS003)
论文发表日期：2025-02-27
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 391-394 )
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