慢性髓性白血病红系分化相关miRNA-mRNA网络的构建与分析
王静艳1
杨玉2
张涛2
彭琳茜2
迟睿3
高吴陆怡2
孙晓航2
商宇2
1.佳木斯大学基础医学院,黑龙江 佳木斯 154000;佳木斯大学附属第一医院,黑龙江 佳木斯 1540072.佳木斯大学基础医学院,黑龙江 佳木斯 1540003.佳木斯大学基础医学院,黑龙江 佳木斯 154000;哈尔滨医科大学附属第二医院,黑龙江 哈尔滨 150001
摘要：目的:确定慢性髓性白血病(CML)红系分化过程中起关键作用的微小核糖核酸(miRNA)和信使核糖核酸(mRNA),并揭示它们之间的网络调控关系以及其对信号通路的影响.方法:利用GEO数据库筛选出CML红系分化后表达显著改变的miRNA与mRNA,并通过DIANA tools分析平台的TarBase v.8工具与Cytoscape软件构建miRNA-mRNA调控网络,进一步筛选出发挥关键作用的枢纽miRNA.使用DIANA tools分析平台的mirPath v.3工具与Metascape分析平台分别对miRNA与mRNA的进行KEGG信号通路富集分析.最后,通过实时荧光定量PCR的方法验证红系分化对CML细胞枢纽miRNA表达的影响.结果:共筛选出表达显著差异的4 281个mRNA与475个miRNA,其中差异最为显著的基因包括ATP2A3、CXCL8、hsa-miR-219a-5p和hsa-miR-154-5p等.miRNA-mRNA 网络分析发现,hsa-miR-520c-3p等4 个miRNA是表达显著降低miRNA的网络枢纽,而hsa-miR-128-3p等11个miRNA是表达显著升高miRNA的网络枢纽.信号通路富集分析发现差异表达miRNA与mRNA主要富集于PI3K-Akt信号通路等.体外实验结果显示,在氯化血红素处理的K562细胞中,hsa-miR-520c-3p的相对表达量显著减少,而hsa-miR-128-3p的相对表达量则显著增加.结论:通过构建miRNA-mRNA网络全面探讨了 CML红系分化过程中miRNA与mRNA之间的调控作用,揭示了发挥关键作用的miRNA与信号通路,为理解CML红系分化的调控机制提供了新视角,并为CML治疗提供了潜在靶标.
关键词：慢性髓性白血病红系分化miRNA-mRNA网络
分类号：R733.72(造血器及淋巴系肿瘤)
论文发表日期：2025-03-10
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 515-519 )
英文信息