基于转移表型筛选相关差异基因构建与验证骨肉瘤预后模型
王大鹏1
张进初1
覃森2
骆华松2
1.湖北省松滋市中医医院,湖北 松滋 4342002.长江大学附属第一医院·湖北省荆州市第一人民医院,湖北 荆州 434000
摘要：目的:基于转移表型差异基因(DEGs)构建骨肉瘤(OS)预后模型,探讨预后基因在OS中的表达及与患者预后的关系.方法:通过生物信息学方法从Targets数据库中获取98例OS患者的转录组测序数据和患者的临床资料.利用基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析OS中DEGs的功能特征.应用单因素Cox回归结合Lasso回归筛选预后相关基因,并据此建立预后预测模型,评估该预后模型的预测性能,进一步通过受试者工作特征(ROC)曲线进行分析,识别OS的独立预后因素.结果:共获得82个差异表达的DEGs.GO与KEGG富集分析发现这些差异基因主要富集在细胞外基质组织、上皮和内皮细胞凋亡的调控、细胞趋化性和对活性氧的反应以及Apelin信号通路等途径.应用单因素Cox及Lasso回归模型共筛选出2个预后相关的DEGs来构建预后模型,分别为Rho GTP酶激活蛋白44(ARHGAP44)和色氨酸2,3-双加氧酶(TDO2).ROC曲线和生存分析证实这2个DEGs构建的风险模型对OS患者的生存情况具有较好的预测价值.结论:文章成功构建了基于DEGs的OS预后模型,发现ARHGAP44和TDO2能够作为OS患者的预后生物标志物,可为OS患者的临床治疗和预后评估提供参考.
关键词：骨肉瘤转移风险评分预后模型
分类号：R738.1(运动系肿瘤)
论文发表日期：2025-12-10
在线出版日期：2025-12-31（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 2823-2826 )
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