高GC含量DNA序列PCR扩增的引物设计
高梅1
刘树人2
李强3
张凌峰4
1.510602 广东广州,解放军458医院检验科2.510602 广东广州,解放军458医院传染科3.南方医科大学南方医院检验科4.510602 广东广州,解放军458医院血库
摘要:目的 建立一种高GC含量DNA序列PCR扩增的引物设计方法.方法 共设计了15对高GC含量(66.0%~84.0%)DNA序列PCR扩增引物,引物Tm值均≥79.7℃,引物Tm差值(△Tm)均≤1℃.对本研究所设计引物及相关参考文献中部分引物的参数进行统计学分析.另外,基于本研究方法,设计了26对引物,以验证该方法在非高GC含量(35.2%~53.5%)DNA序列PCR扩增中的实用性.结果 采用本研究方法,所有15对高GC含量DNA序列均成功扩增;统计结果显示,Tm值和△Tm是影响高GC含量DNA序列扩增的主要因素.结论 设计具有较高Tm值和较低△Tm的引物可有效的解决高GC含量DNA序列的PCR扩增问题.另外,在较高的退火温度下,引物或DNA序列的二级结构无法形成.
关键词:聚合酶链反应高GC含量引物设计
分类号:R34(基础医学)
资助基金:全军医学科学技术研究计划(十一五)(08BJZ07)
论文发表日期:2014-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
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