妊娠期糖尿病相关基因的生物信息学分析
李娜1
杨宇2
涂红勤1
刘昌玲3
1.武汉儿童医院武汉市妇女儿童医疗保健中心产三科,湖北武汉,4300612.解放军武汉总医院保健办3.华中科技大学附属普爱医院门诊办公室
摘要：目的 基于芯片数据采用生物信息学方法,挖掘与妊娠期糖尿病(gestational diabetes mellitus,GDM)进展相关的信号通路和潜在差异表达基因.方法 在GEO数据库中筛选GDM表达谱芯片数据,并通过生物信息学方法进行再次分析.结果 在GEO数据库获得GSE87295、GSE51546芯片数据,将共同差异表达基因信号通路富集获得上皮-间充质转换通路、间充质-上皮转换通路和低氧诱导因子1α转录因子与GDM相关的3条显著相关的信号通路,及调控这些信号通路的13个差异表达基因.通过基于本体的医学信息检索平台(Coremine Medical)发现3个基因与GDM有文献共线相关.通过Gene Mania工具分析发现所有筛选的基因之间都有间接或直接的共表达关系.结论 通过对芯片数据再次分析,筛选出3条信号通路及13个差异表达基因与GDM发生发展相关.
关键词：妊娠期糖尿病表达谱基因芯片生物信息学
分类号：R714.256(产科学)
论文发表日期：2018-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 309-313 )
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