多形性胶质母细胞瘤相关miRNAs的鉴定与分析
刘洪超
史康克
张雨
魏志豪
1.洛阳新区人民医院病理科, 河南洛阳,4710232.洛阳新区人民医院病理科, 河南洛阳,4710233.洛阳新区人民医院病理科, 河南洛阳,4710234.洛阳新区人民医院病理科, 河南洛阳,471023
摘要：目的 筛选多形性胶质母细胞瘤(glioblastoma multiforme,GBM)相关的miRNAs并进行生物信息学分析.方法 从基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)中下载芯片数据集GSE65626,采用BRB-Array Tools鉴定差异表达miRNAs.利用miRanda和TargetScan在线工具预测差异表达miRNAs的靶基因,然后对靶基因进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和通路富集分析,并构建miRNA-Gene互作网络.结果 从GBM组织和瘤旁组织之间共筛选出128个差异表达miRNAs,其中61个上调表达,67个下调表达.GO功能富集分析表明差异表达miRNAs的靶基因主要涉及转录调控、信号传导、轴突导向、细胞粘附、细胞增殖与凋亡调控等生物过程.通路富集分析发现靶基因显著富集于磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol-3-kinase,PI3K)-Akt信号通路、粘着斑、细胞骨架调节、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信号通路、轴突导向等通路.miRNA-Gene互作网络分析鉴定的核心miRNAs有hsa-miR-106b-5p、hsa-miR-195-5p、hsa-miR-5001-5p、hsa-miR-27a-3p、hsa-miR-130a-3p.结论 miRNAs表达异常在人类GBM中发挥着重要作用,为阐明miRNAs在GBM发生发展过程中的分子机制以及开发靶向治疗提供基础.
关键词：微小RNAs多形性胶质母细胞瘤生物信息学细胞粘附细胞骨架信号通路
分类号：R739.41(神经系肿瘤)
资助基金：洛阳市科技计划项目(1503007A-4)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 86-91 )
英文信息