基于16S rRNA的PCR-HRM分析用于细菌快速鉴定的评价
贾明利1
邱会茹2
王佳琳2
薛文成2
丁进亚3
1.124221辽宁盘锦,盘锦市人民医院检验科2.北部战区总医院研究生培养基地3.中部战区总医院检验科
摘要：目的 验证基于16S rRNA PCR-高分辨率熔解曲线(PCR-high resolution melting,PCR-HRM)分析方法快速鉴定临床常见细菌的可靠性.方法 收集186种共计510株临床非重复分离的常见细菌,以基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry,MALDI-TOF MS)鉴定、PCR-HRM分析对细菌进行鉴定,2种方法结果不一致的细菌,进一步用16S rRNA DNA测序确认菌种.结果 510株常见临床分离菌株中,有1株未得到测序结果,故未将其列入统计.MALDI-TOF MS鉴定及PCR-HRM分析不一致的细菌,进一步以16S rRNA全基因测序结果为准;PCR-HRM分析法与MALDI-TOF MS对临床分离菌鉴定区分正确率分别为97.4％ (496/509)和96.1％ (489/509).两种方法鉴定结果无统计学差异(x2=1.535,P=0.215).结论 PCR-HRM技术操作简便、成本低,且闭管操作无交叉污染的风险,该方法能将临床大部分常见细菌区分至属级水平,甚至区分至种,可用于临床常见分离细菌的快速鉴定及大量样本测序前的筛查.
关键词：细菌鉴定高分辨熔解曲线16S rRNA
分类号：R378(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
论文发表日期：2020-02-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 105-109 )
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