LINC00707-miR-338-3p-ITGB8 竞争性内源性 RNA网络与胰腺癌不良预后相关
卢业健
黄克楠
071000 河北保定,陆军第八十二集团军医院肿瘤科
摘要：目的 探讨参与胰腺癌发生发展过程中的竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络,为胰腺癌的发病机制提供新的认识.方法 从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中收集6个胰腺癌数据集,通过GEO2R和STRING工具识别共同差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)和hub基因,利用DAVID工具对共同DEGs进行功能富集分析,利用基因表达谱交互分析数据库(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)、人类蛋白质图谱(Human Protein Atlas,HPA)和 Kaplan-Meier Plotter 分析并确认 hub 基因的基因表达、蛋白表达和预后意义,进一步在StarBase网页工具中探索感兴趣的基因并以此构建ceRNA网络.结果 在6个数据集中发现 191 个共同 DEGs 和 9 个 hub 基因(MET,COL1A1,LAMA3,LAMB3,LAMC2,ITGA2,ITGA3,IT-GB4,ITGB8),主要参与信号转导、细胞粘附、细胞迁移、肿瘤通路、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(phosphatidylinositol-3-kinase/protein kinase B,PI3K/Akt)信号通路等.其中 MET(HR=2.97,P=1.2 × 10-7)、ITGA2(HR=2.8,P=1.2×10-5)、ITGA3(HR=2.58,P=7.5 × 10-5)、ITGB4(HR=2.36,P=0.0025)、ITGB8(HR=1.91,P=0.0025)、LAMA3(HR=3.86,P=3.6 × 10-6)、LAMB3(HR=2.18,P=0.000 25)、LAMC2(HR=3.06,P=0.000 11)均与胰腺癌患者预后不良相关.与正常胰腺样本相比,ITGB8在胰腺癌样本中呈高表达,其受上游miR-338-3p和LINC00707的调控,ITGB8或LINC00707表达越高,预后越差,而miR-338-3p表达越高,生存时间越长.结论 本研究首次发现LINC00707可通过靶向结合miR-338-3p的方式调控ITGB8表达,构成一条与胰腺癌患者生存有关的ceRNA网络,其中可能涉及了肿瘤细胞增殖、迁移、侵袭和耐药的分子机制.
关键词：胰腺癌竞争性内源性RNA预后标志物生物信息学分析分子机制
分类号：R735.9(消化系肿瘤)
论文发表日期：2023-07-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 592-602 )
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