基于生物信息学及体外实验研究降香治疗缺血再灌注损伤作用机制
岳远佳1
李育2
王慧敏1
吉钊1
荣幸1
姜林1
1.830000 新疆乌鲁木齐,新疆医科大学第四临床医学院2.新疆维吾尔自治区人民医院神经外科
摘要：目的 运用生物信息学及细胞实验方法研究降香治疗心肌缺血再灌注损伤(myocardial ischemia-reperfu-sion injury,MIRI)的作用机制.方法 在中医药系统药理学数据库分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)收集降香主要活性成分;再通过 Swiss Target Prediction 选取降香作用靶点.在DisGeNET、人类孟德尔遗传数据库(Online Mendelian Inheritance In Man,OMIM)、治疗靶点数据库(Therapeutic Target Database,TTD)筛选MIRI有关靶点;在Venny得到相同作用靶点.在String输入构筑蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络模型.在Matescape及微生信对降香抑制MIRI损伤的作用靶点进行基因本体(Gene Ontology,GO)分析及京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析.细胞实验,按实验方案分为空白组、模型组、降香高组、降香低组.测定各组细胞活力;测定各组乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH)、肿瘤坏死因子 α(tumor necrosis factor alpha,TNF-a)、白细胞介素1β(in-terleukin 1 beta,IL-1β)及IL-6的含量;测定各组Src激酶、磷脂酰肌醇3-激酶(phosphatidylinositol-3-kinase,P13K)、细胞外调节蛋白激酶(extracellular regulated protein kinases,ERK1/2)、磷酸化细胞外调节蛋白激酶(phosphorylation-extra-cellular regulated protein kinases,p-ERK1/2)蛋白表达.结果 得到相同作用靶点229个,其中Src、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)、热休克蛋白 α(heatshockprotein alpha,HSPα)、血管内皮生长因子(vascular en-dothelial growth factor,VEGF)、PI3K为关键靶点.通过GO和KEGG分析,降香最可能通过凋亡信号通路抑制MIRI.降香组比模型组细胞增殖率显著升高(P＜0.05).降香组比模型组LDH、TNF-α、IL-1β、IL-6含量显著降低(P均＜0.05).降香组比模型组Src、PI3K表达显著升高,p-ERK1/2蛋白表达显著降低(P均＜0.05).结论 降香通过调节Src、PI3K、ERK1/2、p-ERK1/2表达,作用于凋亡信号通路减轻MIRI损伤.
关键词：生物信息学降香凋亡心肌缺血再灌注
分类号：R285.5(中药学)
资助基金：国家自然科学基金(81960699)国家重点实验室开放基金(SKL-HIDCA-2020-8)
论文发表日期：2023-09-28
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 731-736,752 )
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