NUP37的泛癌分析及其在胰腺癌中的功能和预后价值
吴海斌
匡鹏
马丹丹
龚齐
董庆泰
傅涛
430070 湖北武汉,中部战区总医院普通外科
摘要:目的 对核通道蛋白37 kDa(nucleoporin 37 kDa,NUP37)进行泛癌分析,观察NUP37对胰腺癌(pancre-atic adenocarcinoma,PAAD)细胞SW1990增殖、侵袭及迁移的影响.探讨NUP37在PAAD中的表达差异、临床意义及预后价值,并预测NUP37在PAAD中可能的作用机制.方法 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载与整理NUP37在33种肿瘤及11 057例样本的mRNA表达水平及生存预后相关数据,统计分析NUP37在泛癌中的表达及预后情况.分别采用5-乙炔基-2'脱氧尿嘧啶核苷(5-ethynyl-2'-deoxyuridine,EdU)免疫荧光实验、Tr-answell 实验、划痕实验检测过表达NUP37和沉默NUP37对SW1990细胞增殖、侵袭、迁移的影响.利用基因表达水平值的交互式分析平台(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库分析NUP37在PAAD中的表达及预后.从TCGA数据库获取PAAD患者NUP37表达水平、临床病理特征及生存时间等数据,统计分析NUP37表达水平与PAAD患者临床病理特征及预后的关系.通过基因组富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)预测NUP37在PAAD中可能调控的信号通路.结果 泛癌分析结果显示,NUP37在膀胱尿路上皮癌(bladder urothelial carcinoma,BUC)、乳腺浸润癌(breast invasive carcinoma,BRCA)、胆管癌(cholangiocarcinoma,CHOL)等 17 种肿瘤中高表达(P<0.05),且 NUP37 高表达预示着 PAAD、肺腺癌(lung adenocarcinoma,LU AD)、肝细胞性肝癌(liver hepatocel-lular carcinoma,LIHC)等7种肿瘤患者的生存状态更差(P<0.05).GEPIA数据库分析结果表明,NUP37在PAAD组织中的mRNA表达水平显著高于正常胰腺组织(P<0.05),且NUP37高表达组PAAD患者的总生存期显著低于低表达组患者(P<0.05),预后更差.EdU免疫荧光实验检测结果显示,过表达NUP37促进PAAD SW1990细胞增殖(P<0.01),沉默NUP37则抑制PAAD SW1990细胞增殖(P<0.01).Transwell实验检测结果显示,过表达NUP37促进PAAD SW1990细胞侵袭(P<0.001),沉默NUP37则抑制PAAD SW1990细胞侵袭(P<0.001).划痕实验检测结果显示,过表达NUP37促进PAAD SW1990细胞迁移(P<0.01),沉默NUP37则抑制PAAD SW1990细胞迁移(P<0.01).TCGA数据库分析结果显示,NUP37表达水平、N分期是PAAD患者预后的独立危险因素(P<0.05).GSEA研究结果显示,NUP37 mRNA高表达样本富集到细胞周期、蛋白酶体、DNA复制、错配修复等相关基因集(P<0.05).结论 NUP37在PAAD组织中高表达并预示PAAD患者的不良预后.NUP37促进PAAD细胞增殖、侵袭及迁移.NUP37可能是PAAD和泛癌的潜在癌基因和预后生物标志物.
关键词:核通道蛋白37kDa泛癌胰腺癌表达细胞功能预后
分类号:R735.9(消化系肿瘤)
资助基金:湖北省卫生健康委科研项目(WJ2023F038)
论文发表日期:2023-09-28
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 737-742,747 )
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ISSN:2097-2148
年,卷(期):2023,37(9)
所属栏目:基础研究