一种基于基因表达谱的结肠癌特征提取方法
张娅
饶妮妮
王敏
徐尚蕾
1.中国电子科技大学生命科学与技术学院生物医学工程系,四川成都,6100542.中国电子科技大学生命科学与技术学院生物医学工程系,四川成都,6100543.中国电子科技大学生命科学与技术学院生物医学工程系,四川成都,6100544.中国电子科技大学生命科学与技术学院生物医学工程系,四川成都,610054
摘要：目的 利用基因芯片数据识别与结肠癌相关的特征基因,对该疾病的临床诊断和生物医学研究起到有益的参考和借鉴作用.方法 本文建议了一种称为k均值分类信息指数(kmeans information in-dex to classification,kmeans JIC)的特征基因提取方法.该方法首先对基因芯片上的所有基因进行聚类分析,然后挑选出每一类的"主基因",最后以支持向量机为分类工具进行样本类型的判别,以其在训练集和测试集上的错误分类率为依据选取特征基因.结果 先以结肠癌基因表达谱数据为例进行试验,提取到22个基因,分类正确率达到86.4%.再应用于白血病基因表达谱数据中,提取到65个基因,其分类正确率达到100%.结论 新方法能较好地完成肿瘤特征基因的选取,方法简单可行,能在庞大的基因表达数据集中提取出有用信息.
关键词：基因表达谱聚类信息分类指数支持向量机
分类号：Q789(基因工程（遗传工程）)
资助基金：四川省学术与技术带头人培养基金(901008)四川省应用基础项目(J13-075)电子科技大学中青年人才培养计划(601016)
论文发表日期：2008-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 356-360 )
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