基于SELDI-TOF蛋白质谱的三阴性乳腺癌预后分析
余庆邦1
范明1
郑智国2
许沈华2
陈占红2
王晓稼2
厉力华1
1.杭州电子科技大学生命信息与仪器工程学院,浙江杭州,3100182.浙江省肿瘤研究所,浙江杭州,310022
摘要:目的 使用SELDI-TOF蛋白质质谱,分析和寻找影响三阴性乳腺癌预后的新指标.方法 采集浙江省肿瘤医院提供的三阴性乳腺癌样本51例,每例样本均包含病理及质谱数据.将病例数据分为死亡或复发组与无复发组,并统计检验两组间病理因素有无显著差异.首先统计分析两组样本的蛋白质质谱数据,检验样本中具有显著差异的蛋白质峰;然后对具有显著差异的蛋白质峰所在的特征位点使用SVM分类器分析三阴性乳腺癌的预后.结果 统计结果显示,病理因素很难作为精确预测三阴性乳腺癌预后的因素.死亡或复发样本组与无复发组蛋白质质谱存在显著差异.在51例三阴性乳腺癌蛋白质质谱中,发现了7个蛋白质峰P值小于0.01,联合7个峰分类,分类率达90.20%,敏感性达82.35%,特异性达94.12%.结论 SELDI-TOF蛋白质质谱数据分析能够较好地区分三阴性乳腺癌死亡或复发样本与无复发样本,挑选出的蛋白质峰可以为三阴性乳腺癌的预后判断提供新的有价值的标志物.
关键词:蛋白质质谱三阴性乳腺癌病理因素预后因素
分类号:R446(诊断学)
资助基金:国家自然科学基金(61271063)国家重点基础研究发展计划(973计划)(2013CB329502)浙江省自然科学基金(LQ14F010011)浙江省科技厅项目(2012C13019-1)浙江省科技厅项目(2013C332-05)
论文发表日期:2015-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
英文信息展开
航天医学与医学工程

航天医学与医学工程

北大核心CSTPCD
ISSN:1002-0837
年,卷(期):2015,28(4)
所属栏目:学术论著