基于基因影像学方法的肝细胞癌预后影像标记物研究
陈颖1
严壮志2
高欣3
1.上海大学通信与信息工程学院生物医学工程研究所,上海200444;中国科学院苏州生物医学工程技术研究所,江苏苏州2151632.上海大学通信与信息工程学院生物医学工程研究所,上海,2004443.中国科学院苏州生物医学工程技术研究所,江苏苏州,215163
摘要：目的 通过肝细胞癌影像特征和基因模块关联的基因影像学方法,获取生物可解释的影像学标记物.方法 从癌症基因组数据库获取371例肝细胞癌基因表达数据,其中37例有对应的术前增强CT数据.从勾画的肿瘤区域提取639维定量影像特征,基于一致性指数标准,筛选出12个影像特征.对肝细胞癌基因表达数据进行聚类,得到聚类基因模块,并与影像特征构建Spearman相关图,筛选出与基因模块关联的影像特征,最后用Cox回归模型评估其是否具有预后功能.结果 12个影像特征中,4个与预后的基因模块显著相关,3个与生存预后显著相关.其中,小波分量高灰度级小区域增强特征,与代表糖链生物合成的基因模块显著相关,且该影像特征与病人的总体生存周期(P=0.006,风险比=0.16)显著相关;低灰度级长游程增强纹理特征,与代表血管生成的基因模块显著相关,且与总体生存周期(P =0.049,风险比=3.21)显著相关.结论 描述肿瘤小波频率和纹理的影像特征有可解释的生物学含义,并且与生存周期显著相关,这些特征可作为肝细胞癌潜在的影像学标记物.
关键词：肝细胞癌基因影像学生物可解释影像学标记物
分类号：R814(放射医学)
资助基金：国家自然科学基金(81571772)江苏省科技计划(BE2017671)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 449-455 )
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