模拟失重下氧化应激对EA.hy926细胞miRNA表达谱的影响及生物信息学分析
刘佳1
胡桃红1
贾茗雯2
郑洪伟3
姚静4
袁敏5
王静宇5
袁明5
1.中国人民解放军火箭军特色医学中心,北京,1000882.中国中医科学院广安门医院,北京,1000533.锦州医科大学附属第一医院,辽宁锦州,1210004.郑州市第二人民医院,河南郑州,4500005.中国航天员科研训练中心航天医学基础与应用国家重点实验室,北京,100094
摘要：目的 探索模拟失重条件下EA.hy926细胞氧化应激后microRNAs(miRNAs)表达谱的变化及生物学意义.方法 EA.hy926细胞分为对照组(Con组)、对照氧化应激组(Con+ H2O2)、模拟失重组(MG组)和模拟失重后氧化应激组(MG+ H2O2),采用Illumina HiSeq 2500平台开展miRNAs测序并筛选差异表达miRNAs.筛选出的miRNAs以qRT-PCR进行验证,对验证具有显著差异表达的miRNAs进行靶基因预测、靶基因Gene Ontology (GO)功能富集分析、KEGG信号通路分析以及STRING蛋白互作分析.结果 模拟失重下氧化应激导致EA.hy926细胞内miRNAs表达谱发生改变.qRT-PCR结果显示,与Con+H2O2组相比,MG+H2O2组细胞内hsa-miR-29b-3p、hsa-miR-200c-3p表达增加,与miRNA测序结果一致.GO及KEGG通路显著性富集分析结果显示,hsa-miR-29b-3p靶基因显著富集于细胞外基质等生物学过程及局部黏附信号通路,hsa-miR-200c-3p靶基因显著富集于调控细胞代谢过程等生物学过程及miRNA癌症通路等信号通路.蛋白互作分析结果表明,hsa-miR-29b-3p靶基因中COL家族蛋白处于互作关键位置,hsa-miR-200c-3p靶基因中RHOA处于互作关键位置.结论 模拟失重下氧化应激可导致EA.hy926细胞miRNAs表达出现显著差异,其中hsa-miR-29b-3p和hsa-miR-200c-3p可通过对靶基因及其信号通路调节对内皮细胞功能发挥调控作用.
关键词：miRNA测序血管内皮细胞模拟失重氧化应激
分类号：R852.22(航空航天医学)
资助基金：国家重点实验室基金(SMFA14B01)国家重点实验室基金(SYFD160071802)
论文发表日期：2019-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 393-400 )
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